说实话《大唐女法医》的大结局有些匆忙，苏伏一直都是对冉颜死心塌地的，伤害谁也不会伤害她，可是这次居然对冉颜动手。所有情节都让人猝不及防，苏伏黑化，萧颂假死，冉云生成最大反派。
苏伏为救冉颜吞下傀儡药，受东阳夫人控制，药力发作时竟然产生幻觉狂性大发，连冉颜也不放过。冉颜在关键时刻拿出他们的信物，这才唤醒了苏伏的本性，躲过一劫。
火麒社为离间皇帝与萧颂，陷害萧颂有谋反之心，不想就这样吃下哑巴亏的萧颂只能逃走。此时的苏伏已经被黑化，他恨萧颂夺走冉颜，以大理寺官员的身份对他穷追不舍，最后在众人的围攻下，萧颂被苏伏的箭头擦伤，突然口吐鲜血而亡。
但是冉颜不相信萧颂已经死去的事实，她说是要给萧颂验尸，可是却拿起解剖刀划开手腕，企图自尽。苏伏慌了，连忙将她拉开包扎，在拉扯期间，萧颂身上掉出一朵黑色杜鹃花，冉颜这才明白萧颂是假死，必须救活她。
冉颜用障眼法骗过所有人，将萧颂救活，他们联手皇上来一招瓮中捉鳖，利用隋侯之珠的下落把火麒社的人引到大殿。
冉颜一直以为东阳夫人是火麒社的头领，没有想到她的上面还有主人，冉颜的堂哥冉云生居然是隋朝后裔，他才是火麒社的头领。为了反唐复隋建立了火麒社，欲夺取隋侯之珠推翻大唐。
冉云生蛰伏于市这么久就等今天，可是他千算万算，还是没有算到萧颂与皇上联手对付他。火麒社大势已去，东阳夫人被苏伏杀死，冉云生身捆炸药抓住冉颜打算同归于尽。
不得不说，在关键时刻苏伏和萧颂还是很有默契的，他们一个眼神对视就已定好分工，突然一起冲出，萧颂救出冉颜，苏伏与冉云生一起滚下阶梯，炸弹引发爆炸，现场一片血肉横飞。
火麒社已灭，皇上论功行赏，但是冉颜是冉云生的堂妹，皇上下令让冉颜离开京城，不许萧颂与冉颜再相见，一对有情人就这样被生生隔开，无法在一起。冉颜回到苏州做起了老本行仵作，只是没有萧颂的日子太难熬。
一年后，萧颂出现在了苏州，不知为何他不再受皇命所迫，将冉颜拥入了怀中。但同时，一个神秘男人戴着面纱，看着远处的萧颂冉颜说道，我绝对不会让你离开我。看来《大唐女法医》还没有真正大结局，期待第二季早日与观众见面！